El Clásico, cuộc đối đầu kinh điển giữa Barcelona và Real Madrid, không chỉ là một trận bóng đá đơn thuần. Nó là nơi hội tụ của lịch sử, văn hóa, chính trị và trên hết là niềm đam mê bóng đá cuồng nhiệt. Chính vì tính chất căng thẳng và tầm quan trọng bậc nhất, rất nhiều trận Siêu kinh điển đã đi vào lịch sử với những tình huống gây tranh cãi nảy lửa, tốn không ít giấy mực của báo chí và làm dấy lên những cuộc tranh luận không hồi kết trong cộng đồng người hâm mộ.
Một trong những khoảnh khắc gây tranh cãi và đáng nhớ nhất chính là sự trở lại của Luis Figo tại Camp Nou vào tháng 10 năm 2000 trong màu áo Real Madrid, sau vụ chuyển nhượng đình đám từ chính Barcelona. Bầu không khí thù địch bao trùm lấy sân vận động. Các cổ động viên Barcelona đã không ngừng la ó, huýt sáo và ném vô số vật thể lạ xuống sân mỗi khi Figo chạm bóng hoặc thực hiện phạt góc. Đỉnh điểm của sự việc là hình ảnh một chiếc đầu lợn được ném về phía Figo, biểu tượng cho sự phản bội trong mắt các cule. Trận đấu đã bị gián đoạn nhiều lần và sự thù địch này đã khắc sâu thêm mối kình địch giữa hai gã khổng lồ.
Hình ảnh Luis Figo chuẩn bị đá phạt góc tại Camp Nou trong trận El Clásico gây tranh cãi lịch sử giữa Barcelona và Real Madrid.
Không chỉ có những sự kiện bên lề, các quyết định của trọng tài cũng thường xuyên trở thành tâm điểm tranh cãi trong các trận El Clásico. Mùa giải 2010-2011 chứng kiến chuỗi 4 trận Siêu kinh điển chỉ trong vòng 18 ngày trên cả ba mặt trận: La Liga, Cúp Nhà Vua và Champions League. Đặc biệt, trận bán kết lượt đi Champions League tại Santiago Bernabeu đã diễn ra vô cùng căng thẳng. Chiếc thẻ đỏ trực tiếp mà trọng tài Wolfgang Stark rút ra cho Pepe sau pha vào bóng với Dani Alves đã làm thay đổi cục diện trận đấu. Phía Real Madrid cho rằng đó là một quyết định quá nặng tay và Alves đã ăn vạ, trong khi Barcelona bảo vệ quyết định của trọng tài. Huấn luyện viên Jose Mourinho sau đó cũng bị truất quyền chỉ đạo vì lỗi phản ứng.
Tình huống va chạm nảy lửa giữa Pepe (Real Madrid) và Dani Alves (Barcelona) dẫn đến thẻ đỏ gây tranh cãi trong trận bán kết Champions League.
Những tình huống va chạm giữa cầu thủ hai đội cũng thường đẩy nhiệt độ trận đấu lên cao. Các pha vào bóng quyết liệt, những màn đấu khẩu, tiểu xảo hay thậm chí là xô xát không phải là hiếm. Trận Siêu cúp Tây Ban Nha năm 2011 tại Camp Nou là một ví dụ điển hình. Vào những phút cuối trận, một pha vào bóng nguy hiểm của Marcelo với Cesc Fabregas đã châm ngòi cho một vụ ẩu đả lớn giữa cầu thủ và ban huấn luyện hai đội. Trong mớ hỗn loạn đó, máy quay đã ghi lại được khoảnh khắc HLV Jose Mourinho của Real Madrid có hành động chọc vào mắt trợ lý HLV Tito Vilanova của Barcelona. Hành động phi thể thao này đã bị lên án mạnh mẽ và càng làm gia tăng sự căng thẳng vốn có.
Ngoài những sự kiện nổi bật kể trên, còn vô số những tình huống gây tranh cãi khác diễn ra trong suốt lịch sử đối đầu giữa Barcelona và Real Madrid. Đó có thể là những bàn thắng được công nhận hoặc bị từ chối trong gang tấc vì lỗi việt vị, những quả phạt đền gây tranh cãi, những chiếc thẻ phạt được rút ra hoặc bỏ qua một cách khó hiểu. Mỗi quyết định của trọng tài, mỗi pha bóng nhạy cảm đều được mổ xẻ kỹ lưỡng và trở thành chủ đề bàn tán sôi nổi. Ngay cả với sự xuất hiện của công nghệ VAR, những tranh cãi vẫn chưa hoàn toàn chấm dứt, bởi việc giải thích luật và góc nhìn trong các tình huống phức tạp vẫn mang tính chủ quan.
Những trận đấu gây tranh cãi giữa Barcelona và Real Madrid chính là một phần không thể thiếu, tạo nên sức hấp dẫn đặc biệt cho El Clásico. Chúng phản ánh sự kình địch sâu sắc, áp lực khổng lồ và niềm đam mê cháy bỏng của cả hai đội bóng cũng như người hâm mộ. Dù gây ra nhiều tranh luận, nhưng chính những khoảnh khắc đó đã góp phần viết nên những trang sử hào hùng và đầy kịch tính cho cuộc đối đầu vĩ đại nhất thế giới bóng đá cấp câu lạc bộ.